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科研圈炸鍋!納米抗體磁珠憑啥顛覆傳統(tǒng)IP,實現(xiàn)零輕重鏈殘留?

小伙伴們做IP實驗最常碰到的問題就是抗體輕重鏈污染,而最近很火的納米抗體磁珠宣稱“絕對沒有輕重鏈污染!”,這到底是不是真的呢?


要想知道為什么沒有輕重鏈污染,得先知道輕重鏈污染是怎么產(chǎn)生的?我們做IP時,首先在樣本中加入目標蛋白抗體和proteinA/G磁珠,或者Flag磁珠等標簽抗體磁珠,經(jīng)過孵育、洗滌等步驟,洗脫IP復(fù)合物,接著做WB,依次加入一抗(目標蛋白抗體或Flag抗體)、二抗,最后曝光。


抗體污染產(chǎn)生的原因是:我們在洗脫時把IP抗體也一起洗脫下來了,在跑SDS-PAGE時,抗體四聚體變性成了重鏈和輕鏈蛋白,出現(xiàn)在55kD和25kD的位置上;在之后的WB實驗時,二抗不僅識別了一抗,還識別了IP用的抗體,最后不僅曝光出了目標蛋白條帶,還把IP抗體條帶也一并顯示出來了。

IP實驗抗體污染圖


那納米抗體和傳統(tǒng)抗體有什么差別?為什么不會有輕重鏈污染,我們先來看一下抗體結(jié)構(gòu):

抗體結(jié)構(gòu)圖

納米抗體來源于駱駝科動物體內(nèi)的重鏈抗體(HCAb),只有一個重鏈可變區(qū),結(jié)構(gòu)很簡單,沒有傳統(tǒng)抗體55kD和25kD的重鏈和輕鏈結(jié)構(gòu),分子量僅為傳統(tǒng)抗體的1/10。


雖然商品化的傳統(tǒng)抗體磁珠已經(jīng)將抗體偶聯(lián)在了磁珠上,但擁有四條鏈結(jié)構(gòu)的傳統(tǒng)抗體掉落的風(fēng)險要更大,而事實也證明只要煮磁珠洗脫,抗體必然掉落。相反,納米抗體因結(jié)構(gòu)簡單而與磁珠結(jié)合更緊密,難以掉落產(chǎn)生污染,并且分子量小,對IP結(jié)果的影響很小。

 

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